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RIP实验技术介绍
 

RIP技术(RNA Binding Protein Immunoprecipitation,RNA结合蛋白免疫沉淀),是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术。运用针对目标蛋白的抗体把相应的RNA-蛋白复合物沉淀下来,然后经过分离纯化就可以对结合在复合物上的RNA进行分析;即用抗体或表位标记物捕获细胞核内或细胞质中内源性的RNA结合蛋白,防止非特异性的RNA的结合,免疫沉淀把RNA结合蛋白及其结合的RNA一起分离出来,结合的RNA序列通过microarray(RIP-Chip),定量RT-PCR或 高通量测序(RIP-Seq)方法来鉴定(图1)。RIP可以看成是普遍使用的染色质免疫沉淀ChIP技术的类似应用,但研究对象是RNA-蛋白复合物而不是DNA-蛋白复合物。


 

图1 RIP技术(RNA Binding Protein Immunoprecipitation,RNA结合蛋白免疫沉淀)示意图